NUEVO MÉTODO QUE DESCRIBE GENES EN LA ´"MATERIA OSCURA" DEL ADN

Varios científicos del Centro de Regulación Genómica (CRG) han encontrado un nuevo método que mejora el catálogo más importante de genes, el denominado GENCODE. Además, describe nuevos genes en la 'materia oscura' del ADN. Este nuevo método permite mapear los genes más precisa, rápida y económicamente.

Para la investigación biomédica, la información de la secuencia del genoma humano es primordial en sus estudios.

Sin embargo, el valor de esta información se encuentra muy limitado porque no contamos con mucha información acerca del genoma humano. Los genes son las unidades básicas responsables de las características biológicas en los organismos.

Hoy en día, disponemos de información detallada sobre los genes que codifican para proteínas, pero la información sobre las regiones del ADN que no codifican para proteínas -conocidas como la 'materia oscura' del ADN- todavía queda un largo camino por descubrirla. En estas zonas, hay unos genes que de momento no son muy conocidos llamados 'ARN largos no codificantes'. Son muy numerosos y están relacionados con diversas enfermedades.

En un trabajo publicado en la revista Nature Genetics, un equipo internacional de científicos, liderado por investigadores del Centro de Regulación Genómica en Barcelona, en colaboración con investigadores del Cold Spring Harbor Laboratory de Nueva York, del Wellcome Trust Sanger Institute de Hinxton y de la empresa qGenomics en Barcelona, aporta nueva luz sobre este tema. Para identificar mejor y mapear estos 'genes de la materia oscura', han conseguido desarrollar un nuevo método que mejora el rendimiento y la precisión de los métodos actuales.

Rory Johnson, antiguo investigador en el CRG, explica: "el 98% de nuestro ADN no codifica para proteínas. Estas regiones de ADN contienen miles de genes no codificantes que no están caracterizados y todavía queda un largo camino hasta que comprendamos sus funciones y su papel en las enfermedades. Para ello, necesitamos tener mapas completos de todos los genes. Nuestro método representa un paso muy importante en esta dirección".

En este nuevo método, llamado RNA Capture Long Seq (CLS), la principal característica es que se centra específicamente en las regiones no codificantes del genoma. Éstas se han amplificado y analizado mediante las técnicas más avanzadas de secuenciación. "De este modo, hemos podido producir un mapa detallado de más de 3.500 ARN largos no codificantes en humanos y ratones. Y eso nos ha permitido describir las características genómicas de ARN largos no codificantes para comprender mejor cómo funcionan", dicen los investigadores Julien Lagarde y Barbara Uszczynska, primeros autores del trabajo en el CRG.

Este nuevo método fue usado por los investigadores para mejorar una de las bases de datos genómicas más importantes: GENCODE, que es la referencia mundial para los genes codificantes en los genomas de humano y ratón.

"Científicos en todo el mundo están utilizando GENCODE para sus proyectos de investigación como datos de referencia. Así que mejorar GENCODE, implica contribuir a la investigación biomédica mundial", afirma Roderic Guigó, coordinador del programa de Bioinformática y Genómica en el CRG y colíder del trabajo. El Dr. Guigó inició GENCODE en 2003 como parte del proyecto ENCODE (Enciclopedia de los Elementos del ADN).

Ahora, gracias a este nuevo método, Guigó y colaboradores han mejorado cosniderablemente los catálogos de genes, en concreto, los genes de ARN largos no codificantes. "Hemos encontrado un método más rápido, preciso y económico que nos ha permitido mejorar un catálogo que beneficiará en un primer momento a la comunidad científica, para luego, beneficiar a toda la sociedad", concluye Guigó.

Casi 20 años después del Proyecto del Genoma Humano y gracias al desarrollo de tecnología cada vez más potente, nuestra comprensión sobre la información comprendida en el genoma sigue evolucionando. Una mejor comprensión del genoma nos llevará hacia una mejor comprensión de la salud y la enfermedad.

Fuentes: EcoDiario, El Confidencial