CREAN BASE DE DATOS DE MOLUSCOS PARA VER LA CONTAMINACIÓN EN ZONAS COSTERAS

La Universidad de Córdoba ha formado parte en la creación de una base de datos de un molusco clave para  estudiar la contaminación en zonas costeras, esta investigación ha conseguido identificar distintas proteínas asociadas a 174 procesos biológicos en un tipo de coquina y podría facilitar la detección de contaminantes más rápidamente.

Así lo ha indicado la institución universitaria en una nota diciendo que la Scrobicularia plana es un tipo de coquina distribuido en gran cantidad por las costas y estuarios del norte de Europa, el Mediterráneo y África Occidental, y, al igual que otros moluscos, se utiliza como bioindicador para estudiar la contaminación en este tipo de ecosistemas debido a su capacidad para acumular metales pesados y contaminantes orgánicos.

Un nuevo trabajo de investigación ha conseguido identificar el transcriptoma y su proteoma asociado de este bivalvo, un hallazgo que podría ayudar enormemente en la detección temprana de contaminantes en zonas costeras.

Si el genoma es el contenido de ADN que comprende la información genética esencial para la vida, el transcriptoma incluye solo la información de los genes que se expresan, mientras que el proteoma es la totalidad de proteínas expresadas en el momento y condiciones específicas, siendo su reconstrucción clave para poder entender los efectos moleculares de la contaminación.

El trabajo se ha iniciado con una colaboración del Instituto de Ciencias Marinas de Andalucía, el grupo de 'Biología molecular de los mecanismos de respuesta a estrés' de la UCO y el Servicio Central de Apoyo de la Investigación (SCAI) de la institución universitaria, que se ha encargado del componente bio-informático, fundamental para la reconstrucción del transcriptoma.

           

Tras aislar muestras de ARN de este molusco en condiciones controladas, se han extraído pequeñas secuencias genéticas. Consiguiendo así, combinar tres algoritmos matemáticos para poner en orden todos estos pequeños fragmentos, hasta reconstruir genes enteros y unir todas las piezas de este estudio biológico.
Tener esta herramienta aumenta las probabilidades de éxito de nuevas investigaciones, no solo en estudios con este bivalvo concreto sino en otros moluscos similares.

Hasta la fecha, no se había producido ningún estudio similar en organismos de este tipo. Gracias a esto ahora se podrá  detectar mejor el efecto de la contaminación en ecosistemas marinos antes de que los daños sean irreparables.

Fuentes: europapress,EFEverde